Οι Μονάδες Υγείας στη Θεσπρωτία, δηλαδή το Νοσοκομείο Φιλιατών, το ΤΕΠ Ηγουμενίτσας, τα Κέντρα Υγείας, ανήκουν πλέον στην 3η Υγειονομική Περιφέρεια με έδρα τα Ιωάννινα.
Στο πλαίσιο αναδιάρθρωσης των Υγειονομικών Περιφερειών, δημιουργήθηκε η 3η Υγειονομική Περιφέρεια Ηπείρου- Δυτικής Μακεδονίας, όπου περιλαμβάνονται οι Νομοί Άρτας, Θεσπρωτίας, Ιωαννίνων Πρέβεζας, Γρεβενών, Καστοριάς, Κοζάνης και Φλώρινας.
Η Επικράτεια διαιρέθηκε πλέον σε επτά Υγειονομικές Περιφέρειες, τα γεωγραφικά όρια των οποίων ταυτίζονται με τα όρια των επτά Αποκεντρωμένων Διοικήσεων της χώρας.
Αυτό το σχήμα φαίνεται ότι στην πράξη θα λειτουργήσει πολύ καλύτερα από το προηγούμενο, αφού θα υπάρχει μια γεωγραφική συνάφεια, άρα και ανετότερη παρακολούθηση των Μονάδων Υγείας, καθώς και αποτελεσματικότερη δυνατότητα παρεμβάσεων.